三个月宝宝可以长期吃维生素B1的判断需要根据以下因素综合考虑：
1. 宝宝的饮食习惯和营养状况
如果宝宝已经能够摄入足够的维生素B1，例如食物中富含维生素B1的高蛋白食品（如肉类、豆类等），则不需要额外补充维生素B1。
2. 宝宝的健康状况
如果宝宝有维生素B1缺乏的症状或者食欲不佳，可能需要适量补充维生素B1。
3. 维生素B1的安全性
维生素B1是水溶性维生素，过量摄入通常不会导致副作用，但过量摄入也是不必要的。
综上所述，三个月宝宝可以在医生的建议下适量补充维生素B1，但不宜长期过量使用，毕竟母乳和配方奶粉中都已经含有足够的营养成分，如果宝宝的饮食结构良好，可以不必额外补充维生素B1，以免引起其他健康问题。
