对于三个月宝宝的补钙，最好的时间是在喂养母乳期间进行。母乳本身就富含钙质，可以满足宝宝生长发育的需要。然而，如果宝宝出现以下情况，就需要考虑进行钙的补充：
1. 宝宝出现缺钙症状，如手足抽搐、哭闹不安、呕吐等。
2. 宝宝接受人工喂养，无法从母乳中获得足够的钙质。
3. 家族中有遗传性骨质疏松等骨骼疾病史。
在进行补钙时，需要注意以下几点：
1. 遵循医生的建议，按照剂量和时间进行补钙。
2. 使用高质量的钙补充剂。最好选择含有维生素D、镁和锌等微量元素的产品。
3. 将钙补充剂加入宝宝的配方奶粉或纯净水中。不要直接添加到母乳中。
4. 配合宝宝的体重和年龄，根据医生的建议，及时进行补钙调整。
总之，在进行三个月宝宝的补钙时，需要根据宝宝的实际情况，按照医生的指导进行，遵循科学合理的原则，以确保宝宝得到足够的营养和支持骨骼健康生长发育。
