在孕早期，即6周左右，胚胎还很小，只有约4毫米长，而且主要是由头部和身体发育不全的基本结构组成。此时进行胎儿畸形检查可能不太可靠，因为要确诊大多数畸形，需要等到胚胎发育到7-8周甚至更长时间。
但是对于高风险孕妇，比如有家族遗传病史，或者曾经多次流产、早产等情况，建议在孕早期就进行宫腔镜或者羊水穿刺等特殊检查。这些检查通过收集羊水或胎盘组织等，在孕早期就能够准确检测出胎儿畸形。
此外，孕妇还可以选择非侵入性唐氏筛查或先露筛查等可靠率较高的筛查方法。这些方法通过孕妇采集血液样本，分析孕妇体内的唐氏综合征和先天性心脏病等胎儿畸形的风险，帮助孕妇及家庭了解胎儿的健康情况。
总的来说，孕6周时不能确诊胎儿畸形，但是对于高风险孕妇和担心胎儿畸形的家庭，可以通过特殊检查和筛查方法了解胎儿的健康情况，早做准备和处理。同时，孕妇要注意保健和避免不良生活习惯，尽量保障胎儿的健康成长。
