据科学研究和临床实践证实，香菇菌种不会导致胎儿畸形。香菇是一种可以食用的真菌，其主要成分是多糖和蛋白质等营养成分，对人体有益的营养价值是得到普遍承认的。而在临床实践中，已经有很多孕妇在怀孕期间摄入香菇，最终生下健康的宝宝。因此，从临床实践来看，香菇并没有导致胎儿畸形的风险。
香菇菌种不会导致胎儿畸形的原因，在于香菇中并不含有任何有害物质或毒素。相反，香菇富含多种营养成分，如蛋白质、钙、铁、维生素等，可以促进孕妇的营养摄入，提高孕妇体内的免疫力，对胎儿的生长发育起到很好的促进作用。另外，香菇还具有抗氧化、抗肿瘤、降血脂等多种保健功效，在孕期适量食用有益无害。
需要注意的是，孕妇在选择食用香菇时应挑选新鲜、优质的香菇，并注意食用量的适度。过量食用香菇可能会引起消化不良等身体不适。此外，孕期食用任何食物都需要根据个人身体状况和孕期阶段进行判断，如果身体有不适或者孕期特殊情况，应该及时咨询医生和营养师。
