胎儿系统畸形是指胎儿在发育过程中出现的器官及组织结构异常或发育障碍，其原因尚不完全了解，但目前认为主要与以下几个方面有关：
1. 遗传因素。遗传因素是胎儿系统畸形的主要原因之一。影响胎儿发育的遗传因素包括染色体异常、单基因遗传病、多基因遗传病等。
2.环境因素。环境因素是影响胎儿系统畸形的重要因素之一，包括母体在孕期所接触到的有害物质、母体的不良生活习惯以及感染等。母体在孕期接触的有害物质包括药物、化学物质、辐射等，这些因素的作用可能会引起母体染色体异常，从而影响胎儿的正常发育。母体的不良生活习惯，如饮酒、吸烟、药物滥用、压力等，也会对胎儿发育产生不利影响。感染也是影响胎儿系统畸形的重要因素之一，如风疹、单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等，这些病毒都可能引发胎儿畸形。
3.营养因素。孕妇饮食不良或者缺乏某些必要的营养成分，如蛋白质、维生素、矿物质等，都可能导致胎儿畸形。
4.其他因素。除了上述因素外，母亲的健康状况、孕期中的其他疾病如高血压、糖尿病、卵巢早衰、甲状腺疾病等也会影响胎儿的正常发育。
综上所述，胎儿系统畸形的原因是多方面的，包括遗传因素、环境因素、营养因素以及其他因素。为了减少胎儿系统畸形的发生，孕妇应该注意保持良好的生活习惯和饮食习惯，避免接触有害物质，并积极做好孕期检查和孕期保健工作。
