孕十一周的胎儿已经完成了大部分器官和系统的发育，并进入了第二个月。在这个阶段，如果胚胎受到不良因素的影响，仍有可能出现畸形。 畸形是指胎儿在发育过程中出现的一些结构或功能异常，可以导致身体某些部位或器官的缺失、变形或不能正常工作。 这些畸形可能来自遗传因素、环境因素、药物作用或母体疾病等。
遗传因素是导致胎儿畸形的最常见因素之一。父母的遗传物质会通过生殖细胞传递给胎儿，如果这些遗传物质携带了异常基因，则可能导致胎儿畸形。例如，唐氏综合症等遗传性疾病就属于这种类型。
环境因素也可以导致胎儿畸形。在孕早期的胎儿中，出现畸形的可能性会比较高。因为在孕期前三个月，胎儿的器官正在快速发育中，此时，如果受到放射线、化学物质、细菌感染等外界因素的影响，就会出现畸形。孕妇吸烟、饮酒、使用毒品，也会增加胎儿畸形的发生率。
药物作用也可能导致胎儿畸形。某些药物在孕期使用，可导致胎儿畸形。孕妇在用药前，应该咨询医生并告知自己的孕期，不适合用的药物一定要避免使用。
母体疾病也可能导致胎儿畸形。例如，糖尿病、甲状腺功能减退、高血压等疾病，都可能影响胎儿的正常发育，导致胎儿畸形。
虽然在孕11周时，胎儿的器官已经大部分形成，但仍有极少的畸形发生率。在孕期将要到来的几个月里，胎儿将不断成长发育，不同器官系统的发育也会相应变化。如果未来几个月胎儿接受了合理的保健和良好的营养，从而保证健康的母亲胎儿，那么胎儿畸形的出现机率会大大地降低。
