孕妇查胎儿畸形通常是通过不同的医学检查方法进行的，以下是常用的几种方法：
1.超声检查：超声检查是最常见的检查胎儿畸形的方法，其优势在于无辐射，便于检查，可以检查胎儿的各种器官和器官系统是否正常，如心脏、肺部、肾脏等。
2.AFP检测：通过对孕妇血样的分析，检测孕妇体内AFP（α-胎蛋白）的含量，以判断胎儿是否存在神经管开放性缺陷的可能。
3.羊水穿刺：如果上述检测方法存在缺陷或者存在不确定性，医生还可以采用羊水穿刺的方法，在孕期16-22周时，取出一定量的羊水，进行胎儿染色体、代谢性疾病等遗传性疾病测试。
4.绒毛活检：这种方法适用于孕期早期，通常在怀孕8周到12周进行。医生需要取出一部分绒毛组织，进行胎儿染色体、代谢性疾病等遗传性疾病测试。
在进行任何检查前，孕妇应该与专业医生沟通，确认对胎儿的损害/风险和自身健康的安全和效益，以便最终做出明智的决定。此外，孕妇在排除畸形的同时，还应注意进行营养、锻炼等方面的保健，避免给胎儿带来其他不良影响。
