宝宝发烧时，可以继续喂益生菌，但需要注意以下几点：
1. 医嘱。如果宝宝发烧较高或症状严重，建议家长先咨询医生的意见，了解益生菌是否适合宝宝，并遵照医生的处方来使用。
2. 观察症状。益生菌有助于维护宝宝的肠道健康，但对于一些病毒和细菌感染引起的发烧，益生菌并不能直接解决问题。需要密切观察宝宝的症状，及时就医。
3. 存储方式。益生菌是活性微生物，需要储存在低温、干燥的环境中，否则会失去活性。在给宝宝喂益生菌时，需要注意存储方式，避免影响益生菌的活性。
4. 喂食方式。可以将益生菌口服剂或粉末加入食物中，或直接给宝宝喂食。需要遵照厂家的使用说明，按照适量给宝宝喂食。
总之，宝宝发烧时可以继续喂益生菌，但需要注意医嘱和症状观察，保证益生菌的活性和正确的喂食方式。同时，建议家长在平时重视宝宝的营养和肠道健康，适量喂食益生菌，以预防宝宝的肠道问题。
