首先，如果宝宝发烧，建议先不要去注射疫苗。因为发烧可能是身体正在对抗某种病毒，而注射疫苗会增加身体的负担，让身体更难抵抗病毒。
其次，若宝宝是因感冒、咳嗽、喉咙炎等轻微症状引起的发烧，一般可以去注射疫苗。但需注意的是，在疫情流行期间，建议尽量避免前往公共场所，尤其是人群聚集的地方。
最后，如果宝宝的病症较为严重，如感染了病毒或细菌，发烧超过38.5℃、出现呕吐或腹泻，或存在其他身体不适症状，建议尽快就医。在确诊病情后，再根据医生的建议决定是否可以接种疫苗。
总之，宝宝发烧能否去南京注射疫苗，要根据具体情况进行判断。如果仅是轻微病症引起的发烧，可以考虑注射疫苗；但若病情较为严重，应优先就医，待病愈后再行注射。
