缺乏维生素D会影响宝宝的骨骼发育，甚至导致佝偻病。而在婴儿期，特别是出生后的头几个月，宝宝的维生素D需求量很高，因为这个时候维生素D的贮存量很低。因此，三个月宝宝缺乏维生素D是可能的。
维生素D在身体中的作用是帮助钙和磷吸收和利用，有助于骨骼健康和生长。天然的维生素D主要存在于鱼类、肝脏、蛋黄、奶油、乳制品以及阳光下暴露的皮肤。然而，对于婴儿来说，尤其是在出生后的头几个月里，这些来源通常是不足的。
母乳是婴儿最好的食品，同时其中的维生素D量也足够满足宝宝的需求。然而，当妈妈的维生素D含量不足时，也会影响到母乳中的维生素D含量。因此，有一部分妈妈需要从外界获取更多的维生素D，并且需要经过医生的指导来选择适当的补充剂。
对于部分宝宝，如果不能获得充足的维生素D来源，就需要额外补充维生素D以确保宝宝的骨骼能够充分发育。一些医生建议，所有在纽约等纬度较高的地区的宝宝，从出生开始每天应该补充400国际单位的维生素D。这个建议也可以根据季节、日光暴露情况、饮食习惯等因素进行调整。
总之，三个月宝宝的维生素D缺乏是可能的。为了确保宝宝充分获得足够的维生素D，建议妈妈在确保自身充足的维生素D含量的同时，还需要根据医生的建议来增加和补充宝宝的维生素D。
