胎儿畸形检查一般由妇产科或遗传科医生进行，具体挂什么科要根据检查内容和检查方法来确定。
1. 超声波检查：胎儿超声波检查是一种常用的胎儿畸形筛查方法，可以在孕期通过医生的超声波探头观察胎儿的生长和发育情况，诊断胎儿是否有畸形。因此，挂号选择超声科是必要的，产科也可以进行超声检查。
2. 羊水穿刺检查：羊水穿刺是通过医生利用细针囊括少量羊水进行检测，对胎儿的染色体、遗传病和胎儿性别进行判断，这种检查属于遗传学范畴，因此挂遗传科较为合适。羊水穿刺是一种有风险的检查方法，具体操作前需要在咨询医生的指导下选择。
3. 绒毛取样检查：绒毛取样是一种较早期的胎儿畸形检查方法，可以在早孕期就进行。通过细长的吸管将一小部分羊膜腔内组织取出进行检查，分析胎儿是否存在染色体畸变或者炎症等情况，对于有遗传疾病家族史的产妇可以选择这种方式进行监测。
综上所述，胎儿畸形检查需要根据不同的检查方法和检查内容选择不同的科室进行挂号，遗传科和超声科是比较常见的科室，不过具体还需要在咨询医生的建议下选择。最重要的是通过检查及时发现胎儿畸形，做好相应的治疗和干预，确保胎儿的健康成长。
