胎儿是否有畸形基因主要需要通过遗传学检测来进行判断。遗传学检测主要分为两类：单基因疾病遗传和染色体异常。
单基因疾病遗传是指由一对基因引起的遗传疾病。此类疾病与父母的基因有关，而且传递模式一般是比较明显的。
对于单基因疾病遗传，一般采用基因检测的方法来进行筛查。该方法需要收集父母两人的DNA样本，通过对相关基因进行检测来确定是否存在携带有相关基因突变的可能。如果父母其中一人为携带者，则胎儿患病的风险为50%。如果父母均不携带，胎儿则不会患病。
染色体异常遗传是由于染色体在分裂过程中发生错误，导致胎儿出现染色体异常的情况。这些染色体异常一般称为“染色体畸形”。
目前较为常见的染色体异常有唐氏综合症、埃德华氏综合症、帕特森氏综合症等等。而对于染色体异常的筛查，目前采用的主要是非侵入性产前筛查和羊水穿刺、绒毛取样等侵入性检验。
非侵入性产前筛查主要是通过母亲的血液样本来进行分析，检测孕妇的基因组中是否存在染色体异常，包括唐氏综合症等多种异常。这种方法虽然不能确定具体染色体异常的类型，但其高准确率，低风险的特点使其被广泛应用。
侵入性检测则更为准确，但是由于这个过程涉及到母体的安全和胎儿的安全，因此不能进行过多的检测。在进行检测前，一定要确定所有的风险和医学意义，同时要充分遵守相关法规和规定，以确保孕妇和胎儿的安全。
总的来说，胎儿是否有畸形基因需要进行遗传学检测来进行判断，而具体的检测方式则主要取决于疾病的类型和医学的实际需求。
