宝宝维生素D3缺乏的原因有很多，主要包括以下几个方面：
1.不足的晒太阳量：维生素D3是由皮肤内的类固醇前体，在紫外线光照射下转化而来的，所以晒太阳是身体获得充足维生素D3的最好途径。但对于宝宝来说，小时候皮肤娇嫩敏感，加之在室内活动时间较多，以及天气不好时无法在户外活动，这些因素都可能导致宝宝晒太阳不足，从而缺乏维生素D3。
2.饮食不均衡：维生素D3在自然食品中含量较低，只有鱼肝油、鱼类、鸡蛋黄等少数食品中含量较高。婴儿出生后初乳中含有较高的维生素D3，随着宝宝生长发育，母乳中的维生素D3含量可能会变得不足够，如果宝宝饮食不均衡、营养缺乏，也会导致维生素D3缺乏。
3.吸收不良：维生素D3需要经过肠道吸收，如果宝宝存在肠道问题，如乳糖不耐受、腹泻、炎症性肠病等，都可能导致维生素D3吸收不良，引起缺乏。
4.其他原因：一些药物、疾病等因素也可能导致宝宝维生素D3缺乏，如长期使用影响肠道吸收的药物，患有肝病、肾病、白血病等疾病等。
为了预防宝宝维生素D3缺乏，父母可以采取以下措施：
1.给宝宝房间保持良好通风、光线充足，每天让宝宝晒太阳。
2.尽量让宝宝接触自然食品，如多食用含丰富维生素D3的海鲜等食物。
3.婴幼儿奶粉和辅食中添加维生素D3，以保证宝宝摄入足够的维生素D3。
4.避免长期使用含钙量过高的药物，以免影响维生素D3吸收。
5.根据医生建议，定期检查宝宝的维生素D3水平，及时调整补充方案。
