基因诊断可以辅助预测胎儿出生后可能存在的疾病和遗传疾病风险，然而，它并不能排除胎儿畸形。
首先，基因诊断只能从基因层面上对一些常见疾病进行诊断，以及预测遗传疾病风险，但并不能完全覆盖所有的遗传病。此外，它还可能受到一些特定基因的变异或多基因遗传的影响而导致误判。
其次，基因诊断对于孕早期的胎儿畸形并不敏感，因为在这个时期，胎儿畸形的痕迹还很微小，无法通过基因检测获取有效信息。即使在后期也可能因为设备不够灵敏或者样本不够完美而无法完全精确地确定胎儿是否存在畸形。
最后，基因诊断仅仅是一种辅助手段，它只能作为医生诊断和定位疾病的工具之一，而不能取代医生的临床判断。因此，夫妻在怀孕前进行基因诊断只能作为一种风险评估，结合其他方式的体检来预测胎儿畸形的风险。
总之，基因诊断对于预防和控制胎儿畸形有重要作用，但它不能取代其他的医学检查和诊断手段，更不能绝对排除胎儿畸形，因此，孕期保健和产前检查的重要性仍需重申。
