生化胎儿畸形是指胎儿染色体异常、基因突变及代谢异常等引起的胎儿异常发生。生化胎儿畸形的发生时间主要取决于畸形类型的不同，其中染色体异常是导致人类胎儿畸形的最重要因素之一。
一般而言，染色体异常大多是在受孕的初期就已经发生。严重的染色体异常，如格雷斯综合征、Edwards 综合征和早期性染色体异常，往往会在怀孕前3个月内发生。而通常所述的唐氏综合征（三体21号染色体）生化胎儿畸形可在怀孕的12周内诊断。
另外，代谢异常也可能导致生化胎儿畸形。这类异常的发生时间一般要早于染色体异常。例如，若酮酸尿症（PKU）的母亲在妊娠初期未能控制食物中苯丙氨酸含量，可能会导致胎儿脑部形态异常，这类畸形症状通常在怀孕前3个月内就会显现出来。
总之，各种生化胎儿畸形的发生时间都是不确定的，而且影响因素也较为复杂。因此，孕妇在怀孕期间一定要注意保持健康的生活方式和注意避免可能对胎儿造成伤害的因素，如吸烟、喝酒、接触有毒物质等。同时定期进行产前检查，及时发现胎儿异常并采取相应措施将有助于降低生化胎儿畸形的发生率。
