药物的安全性和危险性不仅受到药物本身作用的影响，药物在怀孕期间应用所带来的影响，也是需要考虑的问题。尤其是怀孕初期，药物所带来的副作用可能会对宝宝的发育造成影响，而且对于药物安全性的评价，通常也会分为怀孕前、怀孕初期、怀孕中期、怀孕晚期和分娩时等不同阶段，因为不同阶段对宝宝的风险也不同。但是，总的来说，大部分药物在怀孕期间应用时，对胎儿畸形的发生并没有明确的证据。
虽然大多数药物在怀孕期间的安全性较高，但还是有一些药物在怀孕期间应用可能会对胎儿造成伤害。这些药物包括承担严重副作用的化学药物、抗生素、疫苗等。妊娠糖尿病药物也有可能对胎儿造成影响。因此，医生要根据雌性患者的病史以及胎儿的情况，综合考虑给药方案，只有在确定使用该药物对母亲的疾病治疗非常必要的情况下，再通过药物带来的心理影响及潜在的副作用，评估对胎儿的影响。
对怀孕女性而言，如何选择药物，避免不必要的药物使用，尽可能少用药，同时提请医生检查所开药方中的药物成分。此外，还需确保怀孕期的足够营养和充分休息，以促进健康胎儿的出生，避免出现胎儿畸形的风险。除此之外，还应根据孕妇的病史和家族遗传病病史来制定前往医院检查孕妇体检以及羊水检查等计划。终归，怀孕期间应避免盲目自我诊断和治疗，合理应用药物有利于孕妇及胎儿的健康。
