咳嗽呛奶三个月了可能是由多种疾病引起的。咳嗽和呛奶是非特异性症状，可能伴随许多不同的疾病。以下是可能导致这些症状的常见原因：
1. 呼吸系统感染：呼吸道感染，如感冒、咳嗽、支气管炎等会导致咳嗽和呛奶。这些疾病通常会自愈，但需要注意休息、保持足够的水分和药物治疗。
2. 嗓子过敏：如果您的咳嗽是由嗓子缘敏感引起的，可能需要确定嗓子过敏的诱因，以便采取相应的治疗措施。
3. 偏头痛：偏头痛是一种神经性疾病，可以导致呛奶和咳嗽。
4. 食道反流病：食道反流病是指胃酸从胃部逆流到食道和喉咙。这可能会导致呛奶和咳嗽。
5. 肺结核：肺结核是一种严重的呼吸道疾病，能引起长期的咳嗽和呛奶。
6. 支气管哮喘：哮喘是一种慢性疾病，以呼吸道炎症和它所致的气道阻塞为特征。它可能会导致长期的咳嗽、呛奶和呼吸困难。
在许多情况下，咳嗽呛奶并不是令人担心的症状。但是，如果您的症状持续了三个月或更长时间，或者伴有其他不适，例如呼吸困难、胸痛或发热等，请立即咨询医生。医生可能会建议进行进一步检查，例如X光、CT等，以了解病因并提供最佳的治疗方案。
