胎儿的性别是由其染色体的组成决定的，通常来说人类的性染色体有两种，即X和Y染色体，其中XX为女性，XY为男性。当胎儿在受精后形成时，如果染色体的配对出现问题则可能出现两性畸形的情况，一般来说有以下几种情况：
1. 染色体数量异常
这种情况是最常见的两性畸形原因之一，即染色体数量发生变化，导致不同于XX或XY的性别形成。例如，当一个女性细胞中的第23对染色体变成X0时，就可能出现Turner综合症。而男性细胞中出现两个X染色体和一个Y染色体时，就可能出现Klinefelter综合征。
2. 遗传基因异常
有一些染色体中的基因是影响性别发育的关键基因，在这些基因异常时，足以导致或影响胎儿性别的发育，这种情况通常由遗传基因异常所导致。例如，可导致两性畸形的完全性雄性假性腺症和新生儿女性特征多疣性是由遗传单基因突变所导致的。
3. 药物、环境等外因干扰
有些药物或环境因素也可能干扰胎儿的性别发育。例如，在怀孕期间暴露于某些有害物质、放射线等环境因素可能导致某些基因或染色体发生异常，或者导致生殖系统发育障碍而导致两性畸形的出现。
总之，胎儿两性畸形的原因是多种多样的，发生机制也比较复杂。我们应该尽可能地保护好自己和身边的人，减少受到有害物质、环境因素的影响，科学合理地规划生育，以保障下一代的健康。
