胎儿畸形发生在受精过程中形成第一细胞分裂开始的发育阶段，即发生在孕早期。一般来说，孕早期包括受精后的前12周，也就是怀孕的头3个月左右。
在受精后的第一周左右，卵子被精子受精，形成受精卵。受精卵会开始分裂成两个细胞，这是胎儿畸形的第一个时间窗口。在这个时候，如果分裂出现问题，就有可能导致胎儿畸形的发生。
接下来的早期分化阶段，胚胎内的细胞开始分化成不同的层次，形成不同的器官和组织。这个过程中也可能出现问题，导致胎儿畸形的发生。例如，如果神经板的形成过程中缺乏某些重要的营养物质或因遗传基因缺陷，就可能导致脊柱裂等神经管缺陷的发生。
在孕早期结束后，胎儿的生长发育速度加快，开始形成器官和组织。如果胎儿在这个时候受到外界毒物、药物或病毒等因素的影响，就可能导致器官和组织发生畸形。例如，妊娠期酒精综合症、药物引起的先天性心脏病等。
总体来说，胎儿畸形的发生与孕早期的种种因素有关，但并非所有情况都可以预防或治疗。孕妇在怀孕期间应该注意健康饮食、避免接触危险物质、定期产检等，以减少胎儿畸形的风险。同时，对于已经确定胎儿存在畸形的孕妇，应该及时接受专业医学建议和治疗。
