胎儿发生畸形的时间是在怀孕早期，通常是在怀孕前3个月内。在这个时期，胎儿器官和身体的结构正在形成，如果在这个时期发生了某些问题，畸形就有可能发生。
其中，最常见的原因是遗传因素。一些遗传变异可能会引起胎儿畸形。这种畸形通常是由一种单基因障碍引起的，例如唐氏综合症、囊性纤维化和先天性肺动脉狭窄等。
此外，母亲的生活方式和健康状况也可以影响胎儿发育。例如，母亲在妊娠期间吸烟、饮酒或使用药物，以及患有某些严重的健康问题（如先天性糖尿病）都可能引起胎儿畸形。
环境因素也是胎儿畸形的一个可能因素。母亲所在的环境污染、暴露在毒物和放射线下等均是导致胎儿畸形的危险因素。
由于胎儿畸形的原因很多，所以预防它们并不容易。但是，如果母亲在妊娠前进行全面的测试，并遵循健康的生活方式（例如不吸烟、不饮酒等），可以最大程度地减少发生胎儿畸形的可能性。此外，妇女在怀孕前在医生的建议下及时补充叶酸，也有助于预防神经管缺陷的出现。
