试管二代胎儿畸形率是影响试管婴儿技术（IVF）的一个重要因素。试管婴儿技术是现代医学技术的一大成果，帮助许多步入不孕不育阶段的夫妇圆梦得到自己的孩子。然而，由于妇女年龄和其他因素的影响，试管二代胎儿的畸形率一直备受关注。
首先，IVF技术本身并不会增加儿童出生缺陷的风险。IVF技术中的试管婴儿是靠着细胞分裂最早阶段的胚胎培养的，而且在培养前都要进行基因检测来筛选出健康的胚胎。试管婴儿产生的问题主要是与其胚胎状态（质量）及母亲或父亲孕前或孕中的健康状况等因素有关。如果胚胎在培育过程中未能稳定发育，或遗传学，母亲健康情况等方面的问题会导致孩子出生时有畸形出现的风险。
其次，试管婴儿的年龄和身体状况是影响二代胎儿畸形率的关键。女性怀孕的年龄是产生畸形的重要因素。试管婴儿在选出了健康的胚胎后，需要进行胚胎移植。在选择胚胎的过程中，年龄和原因不同的胚胎选出来的成功率都是不一样的。如果母亲的年龄大于40岁，或者患有糖尿病、高血压等慢性疾病，拥有健康胚胎的几率会变小。
第三，试管婴儿的方法也会影响二代胎儿畸形率。据研究表明，“单胎”胚胎移植方式比“双胎”移植方式更适合，因为“双胎”移植方式存在许多潜在的风险，包括妊娠时间过短，出生体重过低，以及胎儿畸形等等。这表明，通过单胎胚胎移植和胚胎筛选等措施，可以减少胚胎在移植后的死亡率及减少出生缺陷的风险。
综合而言，试管二代胎儿畸形率存在时，但不是因为IVF本身，而是与血缘、先天缺陷、移植策略、孕前健康状况等生物因素相关。随着技术的进步，对其产生的并发症的预防和控制可以较好地进行管理，将风险降到最低程度，让试管婴儿父母更有信心和勇气去尝试。
