婴儿呛奶时奶液会进入食道和气管，但并不会进入耳朵。这是因为婴儿的食道和气管都是通过喉咙连接在一起，而耳朵与喉咙之间是通过喉管分开的。
当婴儿呛奶时，奶液会进入气管，引起咳嗽反射，咳出大部分奶液，同时也有可能会经过口腔中的鼻咽部，流入食道，最终被胃消化吸收。
如果奶液进入耳朵，会导致中耳感染，称为中耳炎。中耳是由骨头构成的空腔，与咽喉相连，通常情况下通过咽鼓管与外界相通。当其受到感染时，可能会出现耳鸣、疼痛、发烧等症状。
婴儿呛奶的情况很常见，特别是在哺乳期间。为了预防呛奶，建议母亲在哺乳前检查乳头是否有结块、炎症及皲裂，若有这些问题应先处理好这些问题。此外，在哺乳时应保持正确的姿势，确保婴儿吮吸奶头的区域完整包裹住，同时也要注意控制婴儿进食的速度。如果婴儿呛奶了，应采取正确的处理措施，如使其俯卧位，轻拍背部等等。
综上所述，婴儿呛奶时不会进入耳朵，但仍然需要注意呛奶的预防及处理。同时，如果出现耳朵疼痛等情况，应及时就医以避免感染引起的并发症。
