孕三个月后胎儿会有畸形的可能性确实存在，不过这也取决于不同的因素。在胎儿发育的初期，由于染色体或基因突变等不正常状况，胚胎可能会发生畸形。此外，孕妇的生活方式习惯、营养状况、遗传因素等也会影响胎儿的发育情况。
其中影响因素包括：
1. 染色体异常：孕妇携带有染色体异常的基因，其胎儿有大概率遗传到这些异常。畸形的形成本质上是染色体异常造成的。
2. 药物和化学物质：孕期药物和化学物质的安全性很难确定。化妆品、药品和清洁剂、毒草等都可能对胎儿造成影响。尤其是孕妇在怀孕前存有的某些疾病，需要用到药物治疗，这些药物可能影响胎儿健康。
3. 父母年龄：如果父母的年龄过大或过小，胎儿的染色体或基因组可能会发生异常，这时不能排除畸形出现的风险。
4. 环境：空气污染、食品不安全、水污染等环境因素都可能对胎儿造成影响。
为了减少胎儿畸形的发生，孕妇需要做到以下几方面:
1. 孕期保健：孕期保健一定要到位，坚持科学的饮食和根据医嘱定期检查，孕期的保健是非常重要的。
2. 避免染色体异常：孕妇要了解自己和另一半的遗传史和健康史，及时做好对于胎儿相关的基因检测。
3. 禁烟限酒：吸烟、喝酒等均会对胎儿造成损伤，应该杜绝。
4. 避免接触有害物质：接触化学品，如喷雾剂、染发剂、清洁剂等都是尽量要避免的，毕竟孕妇的肚子里长了一个小生命。
5. 加强营养：孕妇应该多摄入富含蛋白质、维生素和矿物质的食物，营养充足有助于胎儿健康。
总而言之，我们必须意识到孕期对胎儿健康的重要性，保持积极正向的态度，加强营养，提高自觉性。
