胎儿先天畸形是指在孕期胚胎发育过程中，由于基因遗传或外部环境等原因导致的生理结构或器官发育异常，最终导致出生时患有某些生理或形态缺陷的一种疾病。根据研究，胎儿先天畸形可发生在孕期的任何时间，在各不同阶段的胚胎发育过程中，都可能引发不同的畸形。
在胚胎形态形成期（第3-8周），大部分器官都在发育，此时胚胎最为脆弱，容易受到母体内环境的影响，从而引起先天畸形。这个时期的胎儿，如果受到毒物、辐射、疾病等因素的影响，就会发生畸形。例如脊柱裂、唇颚裂、心脏畸形、手、足畸形等。
在胚胎器官形成期（第9-16周），器官系统发育趋于完善，此时胚胎的自我修复能力较强，但也不是完全免疫。如果此时胚胎受到母体内干扰，如母体药物、维生素过量、疾病感染等，还是有可能导致器官发育异常，引发畸形的。此时胎儿可出现患肝、腰、肾等内脏器官的畸形。
在胎儿生长期（第17-40周），大多数器官已经完全发育，主要是体重和大小发育。但是，如果此时胎儿受到感染、营养不良、氧气不足等影响，仍有可能引发后天畸形的发生。这个阶段的畸形主要表现为胎儿体重矮小、智力低下、运动功能异常、免疫系统受损等。
总的来说，先天畸形早期发现早期处理是更好的方法。孕妇在怀孕期间要注意保持健康，避免吸烟、饮酒、接触有毒物质等。此外，在妊娠期间做好产前检查也是非常重要的。如果可能存在胎儿畸形风险的孕妇，应该接受足够的产前血清学筛查和医学检查，及早发现和处理问题。
