药物的使用在孕期是需谨慎考虑的。虽然大多数药物在怀孕期间是安全的，但仍有部分药物可能引发胎儿畸形，特别是在孕早期。而这些药物如何影响胎儿与担负高风险的母亲所必需的药物如何平衡的问题，值得医生和病人一同思考。
孕期药物的安全性研究是有限的，因为产生药物毒性的研究大多在治疗对象为非孕妇。关于孕妇和胎儿的前瞻性随机对照临床试验是不可行的，因为道德、法律、技术和其他因素的限制。绝大部分治疗药物的安全性经验来自观察性研究，疫苗，局部剂量以及卫生保健环境等因素也赋予了保障。但一旦孕妇接受药物并出现异常胎儿发育，资讯的检索、验证和解释需要及时。
目前已经明确可以导致胎儿畸形的药物有唐氏综合症最重要的基因畸变字代表，伴随异常的无症状的恶性贫血药物OKT3，和神经管缺陷相关的维生素A和硝基咪鞘唑（nizatidine)。
影响孕妇、胎儿的药物使用的特殊情况包括预防治疗、紧急情况、疫苗使用、特定疾病的治疗、使用成瘾药品等等。医生通常会建议妊娠前、怀孕初期及孕后尽可能避免不必要的药物使用，严格遵照医嘱使用药物。如果必须要用药物，医生应根据药物特性、孕妇自身情况、剂量及时间等方面全面考虑，给予恰当的用药建议。
总之，孕妇应该尽可能地避免药物的滥用和过度使用。保持医生和妇产科医生之间的紧密联系和交流，以确保在治疗疾病时，同时保护胎儿的健康。同时也需要保持良好的生活习惯、饮食健康、身体锻炼等等，以使孕早期胎儿得到更为合适的生长环境，进而预防胎儿畸形的发生。
