胎儿短肢畸形可以是遗传病，也可以是非遗传性因素引起的。其中，遗传性因素是短肢畸形的主要原因之一。遗传病是因为在染色体、基因或某些基因突变上发生变异导致无法正常生长和发育的一类疾病。短肢畸形在遗传病中表现为遗传方式多样，种类繁多，例如唐氏综合症、瑞氏综合症、爱德华氏综合症等。
在非遗传性因素中，短肢畸形发生的原因有很多，如环境因素和母体某些疾病所致的影响，如感染、营养不良、药物影响等。还有一部分是由于自身身体结构原因，如子宫某些形态异常、羊水过量、腹腔过小等原因。此外，另一部分是由于代孕、试管婴儿等高科技人工生殖技术所导致的问题。
总的来看，胎儿短肢畸形既包括遗传因素，也包括非遗传因素。遗传病的短肢畸形是由于自身基因出现了一些突变，使得胎儿无法正常发育，在短肢畸形表现上也有很大的差异。而非遗传因素引起的短肢畸形与环境、母体疾病等因素有关，可能会造成临时或者永久的影响。因此，了解短肢畸形的发生原因，对准确诊断和有效治疗至关重要。
