胎儿能否发现畸形，取决于许多因素。畸形的类型和程度，以及孕妇的产前检查和处理情况都会影响胎儿畸形的发现时机。一般来说，胎儿的畸形会在孕期的不同阶段被发现。
一般在孕12-14周之间是进行唐氏综合症筛查的最佳时期。此时可以通过进行羊水穿刺、绒毛膜组织取样、脐带血细胞DNA检查等方式，对胎儿进行基因检测，也能检查到一些大的结构问题。但是这些检查过程都存在一定风险，需要考虑到可能带来的并发症。
在孕16-20周之间可以进行胎儿结构性检查，如超声检查。这种检查能够发现大多数畸形，包括心脏、头部和四肢等器官和部位的先天性畸形。超声检查还可以检查胎儿的生长和发展情况，以及母体的妊娠情况。在此阶段发现畸形的比例较高，率可能高达4％左右。
在孕后期，如果存在其他医学上的需求，可以进行羊膜腔穿刺或脐带穿刺等方法进行胎儿基因检测。
总之，胎儿的发育是一个动态的过程，畸形可能随时会出现。孕期必要的产前检查和处理，能够及早发现并处理胎儿的问题，对于避免胎儿畸形的出现起到了重要作用。
