肠管畸形是指在胚胎发育过程中，由于肠道的发育异常或发育不完全而引起的先天性畸形。该疾病在胎儿中非常普遍。目前，科学家们尚未确定肠管畸形的复杂病因学机制，但在胎儿发育过程中存在某些因素会增加肠管畸形发生的风险。
1. 环境因素
胎儿在母体中的环境因素可能会导致胎儿患上肠管畸形疾病。饮食不良、暴露于放射线、毒品、有害物质、毒品，使用某些药品都是可能诱发肠管畸形的原因。另外，致导致肠管畸形的环境因素还包括辐射、空气污染、噪音与其他化学物质等。其中，尤为证据充分的是零碎放射，这引起了许多胎儿生长的异常以及不同的人类畸形。
2. 遗传因素
肠管畸形也可能是遗传因素导致的。一些基因变异会使胎儿发生肠道和消化道的发育异常，从而导致肠管畸形的发生。
3. 营养缺乏
胎儿在发育期间所受的营养状况也会导致肠管畸形。如果孕妇在孕期缺乏某些重要的维生素和矿物质，将会影响到胎儿肠道的发育。例如，缺乏叶酸对胎儿的神经管发育就会造成自闭症、兔唇或口腔裂等畸形。
4. 内分泌干扰物
内分泌干扰物也是胎儿肠管畸形的风险因素之一。母体孕期内分泌干扰物的作用会干扰胎儿正常的发育和生长，而导致肠管畸形的发生。
在总体结构上，肠管畸形也存在分类，如口腔裂、食管气管瘘/分离、内、外瘘、无肛症、肛门直肠畸形等。预防胎儿肠管畸形，建议在孕期多吃含叶酸的食物，避免在孕期接触放射线、毒品等有害物质，并注重健康生活方式。同时，应在孕前及时进行一些遗传相关性的检查，有利于尽早识别高风险胎儿，及早避免肠管畸形的发生。
