在怀孕三个月以后，胎儿的器官已经基本发育完毕，一些常见的畸形问题也可以通过检查来发现。以下是几种常用的检查方法：
1.超声检查
超声检查是最常用的检查方法之一，通过超声波成像技术，可以观察胎儿的各种器官是否发育正常、是否有先天性缺陷。常规超声检查一般建议孕妇在怀孕16~20周之间进行，而对于高风险孕妇（如孕前携带特定基因突变、有胎儿畸形家族史等），建议在怀孕13周左右进行首次超声检查。
2.羊水穿刺
羊水穿刺（Amniocentesis）是一种判断胎儿基因及胎儿遗传病、先天性畸形的方法。其采用将一根长针通过腹部穿刺进入子宫腔，然后从胎盘附近抽取羊水进行实验室检测。由于该检查方式具有较高的穿刺风险，因此一般仅在极少数需要的情况下进行，如高龄孕妇、既往生过畸形儿等。
3.绒毛膜采样
绒毛膜采样（Chorionic Villus Sampling，简称CVS）通过在子宫里插入一根细长的管子，从胎盘组织中取出一小部分样本进行检测。它主要用于早期的孕妇筛查，可在怀孕13~14周左右进行，比羊水穿刺更早、更安全，但穿刺的风险仍然较高。
除以上几种方式外，一些简单的检查方法如听胎儿心跳、检查孕妇B超的检查结果等也可以一定程度上发现胎儿的问题。但需要注意的是，这些方法不能完全替代超声、羊膜穿刺、绒毛膜采样等更为准确的检查方法，其结果符合正常范围并不代表孕妇肚中胎儿绝对健康。因此，孕妇在怀孕期间一定要积极配合医生的检查和治疗，保证胎儿的健康和安全。
