畸形的胎儿性别的确定方法主要是从基因的角度进行。在胎儿发育期间，性染色体在生殖细胞的分裂过程中被分配到卵子和精子中，并且决定胎儿的性别。人类一般有46对染色体，其中第23对是性染色体。女性有两个X染色体，男性则有一个X和一个Y染色体。
如果胎儿畸形，那么确定其性别的方法可以是通过羊水穿刺（Amniocentesis）或者绒毛膜取样（Chorionic Villus Sampling）来获取胎儿DNA，然后通过基因检测来确定其性别。这些检测技术可以有效地确定胎儿的性别，但是需要侵入性的操作，有一定的风险，需要根据医生的建议进行选择。
另外，超声波检查也是确定胎儿性别的一种方法。在胎儿12周以后，通过超声波检查可以观察到胎儿的生殖器官。虽然有时候畸形的胎儿可能生殖器官的异常，但是一般还是可以通过超声波观察到生殖器官的形态和特征来确定胎儿的性别。
总之，确定胎儿的性别应该根据孕妇和医生的意愿及具体情况来选择适合的检测方法，尽可能地减少风险。
