胎儿肠道畸形是指发生在胚胎期的肠道发育异常，包括肠道闭锁、肠膜固定不良、肠套叠、先天性巨结肠、先天性肠瘤等。
肠道闭锁是指肠管部分或全部闭锁，使肠道腔隙闭合，无法通畅排泄胎便，严重的情况下可引起肠道扩张、缺血坏死等并发症。肠道闭锁可分为胆汁性和非胆汁性两种，胆汁性肠道闭锁常伴随胆汁反流性胰腺炎，非胆汁性肠道闭锁则是在胚胎期间肠管的缺损形成。肠系膜固定不良是指肠系膜发育异常，导致肠管移位不良，易形成肠套叠等后果。肠套叠是指小肠或大肠的一段被另一段肠道所包裹，发生于小肠者称为小肠套叠，发生于大肠者则称为结肠套叠。肠套叠可导致肠道缺血坏死、肠穿孔等严重并发症。先天性巨结肠是指肠道的部分或全部因肌肉张力不足而发生扩张，肠内容物不能顺畅排出，其中重症者可能需早期手术治疗。先天性肠瘤是胚胎发育过程中肠道神经细胞发育障碍，细胞增生形成肿瘤，并常常伴随先天性巨结肠一起出现，需及早治疗避免肠穿孔及腹腔感染等并发症。
上述肠道畸形严重影响胎儿正常发育，尤其是在早期引起的闭锁、肠套叠等疾病更加需要引起高度重视，对于出现此类症状的孕妇应及时就医。同时，避免孕期吸烟饮酒、避免药物滥用以及适当控制孕期疾病也是预防胎儿肠道畸形的有效措施。
