在孕6周时，胎儿还处于早期发育阶段，很小很脆弱，还没有形成任何明显的特征，包括器官系统的构建也尚未完成。因此，在这个阶段，不能通过常规的检查手段来判断胎儿是否有畸形。
但是，有些胎儿畸形是可以通过遗传学检测来预测的。例如，染色体畸变可以通过羊水穿刺和绒毛活检等方法检测出来，这些检测通常在孕16周后进行。而一些先天性疾病例如唐氏综合症等也可以通过血清筛查来发现。
另外，如果母亲有患某些疾病或者风险因素，也可以通过特别的检查手段来确定胎儿是否有畸形。例如，对于糖尿病、甲状腺疾病或者某些感染病毒等疾病的妇女，可以通过血液检测或者超声检查来了解胎儿的情况。
总的来说，在孕6周时，不可能通过常规的检查手段来判断胎儿是否有畸形。不过，如果有高风险因素，可以通过一些特别的检查手段来确定胎儿的健康状况，为孕期保健提供更好的保障。
