胎儿的发育过程是非常复杂、漫长的，在各阶段都有可能出现畸形。因此，要查出胎儿的畸形，需要采用多种方法并相互协作。具体时间因孕周和检查方法而异，但大致如下：
早孕期(0-12周)
早孕期胎儿脏器形成完成，可出现神经管畸形、染色体畸形等，这时可进行血清学筛查和羊水细胞遗传学检查，常见的指标包括血清β-hCG、PAPP-A、NT等。这些指标对畸形的筛查率在70%-90%之间。
第二孕期(13-28周)
第二孕期除了继续进行血清学筛查，还可以进行B超、羊水细胞遗传学检查、产前基因检查等。这些检查能够发现先天性心脏病、胎儿水肿、唇裂、脊柱裂等畸形。目前，B超技术使孕妇在家门口就可以查出孩子的畸形或其它异常情况。
晚孕期(29周-分娩)
晚孕期检查重点是胎儿大小和胎位，这是因为胎儿大小不同可能是由于畸形造成的，胎位不正常则增加难产的风险。
需要注意的是，科技并非万能，某些畸形即便采用多种检查手段也可能被漏诊，因此建议孕妇在怀孕前就开始注意产前保健，减少畸形的发生率，为胎儿健康发展打下良好的基础。
总之，在整个孕期中，密切的跟诊和科学的检查是查出胎儿畸形的重要保障，一旦发现胎儿有畸形，要在医生的指导下综合考虑各种因素，制定合理的治疗方案。
