胎儿是否有先天性畸形的确诊需要依靠医学检查。因为胎儿的器官在出生前就已经发育完毕，因此通过B超或其他检查手段可以较为准确地诊断胎儿是否有畸形。
通常来说，医生会根据怀孕的时间和母体的情况来建议进行胎儿畸形检查的时机。一般建议在怀孕20到24周之间进行详细的筛查，因为此时胎儿器官发育已经比较完整，可以更准确地判断是否有畸形。但是，在特定情况下，医生可能会在怀孕的早期进行超声检查，以尽早发现胎儿的问题。
以下是常见的胎儿畸形检查手段：
1. 超声检查：这是一种常见的检查方式，通常在怀孕20周左右进行。医生通过超声波照射腹部，可以看到胎儿的头部、四肢、躯干、脑部、心脏等重要器官是否发育正常。此外，超声检查还可以检查各种疾病，如水肿、胎盘位置、胎儿大小等。
2. 羊水穿刺：这是一种取出胎儿羊水进行检查的方法，通常在怀孕16周到20周之间进行。医生通过腹部或经阴道插入工具，从羊膜囊中取出羊水，然后对羊水中的胎儿细胞进行分析。这种检查可以检测出一些遗传病。
3. 绒毛活检：这是一种早期检查方法，在怀孕10周到12周之间进行。医生通过阴道插入一根细长的工具，取出胎盘组织进行检查。这种检查可以检测出绝大部分染色体异常状况。
总之，胎儿的畸形检查需要专业医生的指导和具体情况对症施治。孕妇应该定期前往医院进行检查，及时发现并处理胎儿问题，为孕育健康宝宝打下基础。
