怀孕两周的胚胎还处于很早的发育阶段，此时还没有形成器官系统，更没有成型的肢体、器官等。因此，一般情况下这个时候进行X光检查对于胚胎的发育不会造成太大影响，也不会导致明显畸形等问题的出现。
但这并不代表孕妇可以盲目的进行X光检查。因为，X光属于一种高能量的电磁波，能够穿透人体深部组织，但同时也具有一定的辐射性。如果孕妇在怀孕早期就频繁地接受X光辐射，可能会对胎儿的DNA、染色体等造成伤害，从而增加胎儿出现畸形、智力低下等问题的风险。
因此，孕妇在怀孕早期应该尽量避免接受X光检查。如果发生了意外事故需要进行X光检查，应该尽可能地减少辐射剂量，确保身体安全的前提下进行，同时要告知医生自己怀孕的情况，以便医生在检查过程中注意保护胎儿的安全。
总之，怀孕两周的胚胎进行一次X光检查不会导致畸形等问题的出现，但孕妇应该尽量避免X光辐射，确保胎儿的安全。如果需要进行X光检查，一定要在医生指导下进行，减少辐射剂量，避免对胎儿造成伤害。
