在孕期中，在胚胎发展的不同阶段，不同的畸形诊断方法也被使用。下面是根据孕周不同，进行胎儿畸形诊断的方法：
第一孕周至第九孕周（起始孕期）
在这一时期，为了预防畸形出现，孕妇需要注意饮食和药物的使用。最好在预备怀孕时就进行体检，确保自己的身体状况良好。如果没有意外，这个孕期很少进行胎儿畸形检查。
第十孕周至第十三孕周（早期胚胎）
在这个时期，孕妇需要进行羊水穿刺（Amniocentesis）检查，通过检查羊水中的细胞来检测胚胎是否存在染色体异常，如唐氏综合症、艾伯特综合症等。
第十四孕周至第二十一孕周（中期胚胎）
在这个时期，孕妇可以通过经腹超声、经阴超声等技术来检测胎儿是否有畸形。经腹超声和经阴超声是检测胎儿是否有畸形和判断孕妇是否存在高危因素的主要方法，不会对孕妇和胎儿造成任何伤害。
第二十二孕周至第四十周（晚期胚胎）
在这个时期，孕妇可以进行胎盘穿刺（Chorionic Villus Sampling）检查，用来检测胎儿基因异常的检查。此外，还可以通过B超来检查胎儿的器官是否正常发育、胎儿外观是否有异常。
总体来说，孕期的胎儿畸形检查需要结合孕期不同阶段的不同技术，特别是在孕期中、晚期时，采取多项综合技术，以提高畸形诊断的准确性和可靠性。同时，孕妇在进行胎儿畸形检查时，也需要密切关注医护人员的指导和建议，注意饮食、药物使用和生活方式等方面，保障自身和胎儿的健康以及预防畸形出现的发生。
