胎儿严重畸形是指胎儿的某个器官、组织或结构发生异常，影响其健康发育和正常生理功能的过程。其病因非常复杂，可能是由以下多种因素引起的。
1.染色体异常：染色体畸变是导致胎儿器官发育障碍和畸形的主要原因。常见的染色体畸变有三倍体、单体、四体等，这些畸变将导致胎儿器官、组织和结构的正常发育受到影响，从而引起严重畸形。
2.遗传因素：遗传因素也是引起胎儿畸形的重要原因。家族遗传，例如染色体突变、单基因遗传病等，都会导致胎儿畸形。
3.环境因素：孕妇在孕期暴露于各种有害因素，如放射性物质、某些化学物质、农药、毒品、酒精、尼古丁等，都会对胎儿产生毒害作用，引发胎儿畸形。
4.药物因素：孕妇在服用某些药物时，可能会对胎儿产生负面影响，导致畸形。例如治疗癫痫的药物苯妥英、抗生素四环素等，在孕妇服用时可能会影响胎儿的骨骼发育和牙齿变色等。
5.营养因素：孕妇缺乏重要营养素，如叶酸、铁、维生素A等，可能导致胎儿发育迟缓或畸形。
总之，胎儿严重畸形的病因是多方面的，而且各种因素相互作用，彼此影响，因此孕妇在孕期应该注意合理饮食、避免接触有害物质、规律生活等，以减少胎儿畸形发生的风险。同时，在备孕期间可以通过遗传咨询和产前诊断等方式，及时发现胎儿畸形，提前制定治疗和改善措施，以保证胎儿的健康发育。
